本中心主要任務在促進東部地區科學教育的發展,例如大眾科學教育活動的推廣、全民科學人才的培育、科學教師專業成長等。而提供自然與生活科技領域各級教師進修與研習的機會,以促進其專業成長是本中心首要任務。同時本中心也與小學及國高中自然教師保持密切互動,合作進行學術性研究或行動研究,協助教師解決教學現場的問題。而在社會大眾科學教育方面,透過辦理科學性的活動或演講,以促進全民科學素養的提升。


          科學與人文有所謂的一道鴻溝(Snow, 1959),如何促進此一鴻溝的跨越與交會,則是科教中心的終極任務。